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RNA, local moves on plane trees, and transpositions on tableaux

机译:RNa,在梧桐树上的局部移动,以及在桌面上的换位

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摘要

We define a collection of functions $s_i$ on the set of plane trees (orstandard Young tableaux). The functions are adapted from transpositions in therepresentation theory of the symmetric group and almost form a group action.They were motivated by $\textit{local moves}$ in combinatorial biology, whichare maps that represent a certain unfolding and refolding of RNA strands. Onemain result of this study identifies a subset of local moves that we call$s_i$-local moves, and proves that $s_i$-local moves correspond to the maps$s_i$ acting on standard Young tableaux. We also prove that the graph of$s_i$-local moves is a connected, graded poset with unique minimal and maximalelements. We then extend this discussion to functions $s_i^C$ that mimicreflections in the Weyl group of type $C$. The corresponding graph is no longerconnected, but we prove it has two connected components, one of symmetric andthe other of asymmetric plane trees. We give open questions and possiblebiological interpretations.
机译:我们在平面树集(或标准Young tableaux)上定义函数$ s_i $的集合。这些功能是根据对称基团的表示理论中的转置而改编而成的,几乎形成了一个基团的作用。它们是由组合生物学中的\ textit {local move} $所驱动的,这些图代表了RNA链的某种展开和重新折叠。这项研究的一个主要结果是确定了局部移动的子集,我们称之为$ s_i $-局部移动,并证明$ s_i $-局部移动对应于作用于标准Young tableaux的地图$ s_i $。我们还证明了$ s_i $-局部移动的图是一个具有唯一最小和最大元素的连接的渐变姿势。然后,我们将讨论扩展到模仿$ C $类型的Weyl组中的函数$ s_i ^ C $。对应的图不再连接,但我们证明它具有两个连接的组件,一个是对称的,另一个是不对称的平面树。我们提出开放性问题和可能的生物学解释。

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